Utilisation du logiciel TNPC (Traitement Numérique des Pièces Calcifiées): formater un set d’images pour l’analyse de forme (Harmoniques de Fourier)
Le logiciel TNPC (Traitement Numérique des Pièces Calcifiées, www.tnpc.fr) permet de réaliser des acquisitions d’images à partir de microscopes, loupes binoculaires, scanners ou tout autre système d’observation combiné à une caméra numérique. Il a été développé par l’institut Ifremer (initialement par le LASAA, laboratoire de Sclérochronologie des Animaux Aquatiques) depuis une trentaine années en partenariat avec la société VSG (Visualization Sciences Group) pour répondre spécifiquement aux besoins en Sclérochronologie, c’est à dire l’interprétation des pièces calcifiées (otolithes, écailles, vertèbres, coquille, illicium, statolithes…). Ainsi, en plus des acquisitions, il permet d’utiliser de nombreuses fonctions en particulier, l’interprétation d’images individuelles ou en base de données et de travailler sur les mesures, analyses de forme …
Cette vidéo présente spécifiquement le tutoriel pour la fonction du logiciel TNPC :
Utilisation du logiciel TNPC (Traitement Numérique des Pièces Calcifiées): formater un set d’images pour l’analyse de forme (Harmoniques de Fourier)
Elle aborde différents points:
- Creation d’une base de données
- sélection de la méthode de détourage,
- création d’un groupe de mesures,
- réaliser une exportation d’images en format Tiff,
- réaliser une rotation de l’ensemble des images,
- paramétrer l’analyse en base de données (type Harmoniques de Fourier)
- Format des données obtenues,
- Exportation des réultats.
Elleboode Romain, Mahe Kelig (2016). Utilisation du logiciel TNPC (Traitement Numérique des Pièces Calcifiées): formater un set d’images pour l’analyse de forme (Harmoniques de Fourier). SEANOE. https://doi.org/10.17882/43111
Fave sébastien, Crepin Emeline, Magalhaes José Ramos, Ogor Andre, de Pontual Helene, Mahe Kelig (2013). TNPC software - Traitement Numérique des Pièces Calcifiées / Numerical Treatment of Calcified Structures : Développement d’un logiciel dédié à l’analyse des pièces calcifiées :. Colloque de Sclérochronologie : Structures dures ou calcifiées chez les organismes aquatiques : leur utilisation en écologie halieutique, 2-4 Juillet 2013, Rennes. https://archimer.ifremer.fr/doc/00148/25905/